消化內科是醫院重要臨床學科，是“國家臨床重點專科”建設單位、“廣東省臨床重點專科”，是“廣東省肝臟疾病重點實驗室“的重要組成部分，所屬消化內鏡中心是“廣東省消化內鏡工程技術研究中心”，學科也是廣東省醫學會“胃食管靜脈曲張學組”與“酒精肝學組”組長單位。本學科承擔中山大學消化內科學碩士及博士培養任務,是消化內科學博士后流動站，也是分子生物學博士培養點與博士后工作站，國家973計劃首席科學家單位、廣東省教育廳重點實驗室“中-美聯合肝癌研究中心”主體單位，目前在讀碩士研究生、博士研究生、博士后幾十名。消化內科由消化專科病區（天河院區、嶺南院區、粵東院區、肇慶院區組成，規劃床位近200張）、消化疾病門診（包括專家門診、專科門診、專病門診、特需專家門診）、消化內鏡中心、胃腸功能室、胃腸動力檢查室、消化疾病臨床研究室、消化疾病基礎實驗室七個單元組成，是集醫療、教學、科研為一體，充滿活力、不斷發展壯大、與國際接軌的現代化學科。
消化內科包括胃腸疾病專科、膽胰疾病專科、肝硬化專科、酒精性肝病中心，消化內鏡中心5個亞專科。擁有專科醫師26人，臨床型博士后6人，實驗專職研究人員1人，轉化醫學研究人員1人，行政助理1人和科研助理1人。高級職稱醫師15人，主治醫師7人，住院醫師4人。學科擁有博士學位26人，碩士學位9人。
消化內科醫療工作主要覆蓋的疾病包括：食道、胃、小腸、大腸各種疾病，肝、膽、胰腺、腹膜等相關疾病，如消化道出血、消化性潰瘍、炎癥性腸病、胰腺炎、肝硬化、膽道結石（黃疸）及消化道腫瘤（食道癌、胃癌、結腸癌、胰腺癌、肝癌等）等。消化內鏡中心暨“廣東省消化內鏡工程技術研究中心”擁有世界最先進的各種內鏡整套設備及技術，是廣東省開展消化內鏡診斷及治療項目最全面的醫院之一，每年完成超五萬例次的內鏡檢查及內鏡治療。消化道出血，肝硬化、肝癌、脂肪肝、酒精肝、肝功能不良，消化道潰瘍、消化道腫瘤、炎癥性腸病、反流性食管炎的診治是我科的特色；食管胃靜脈曲張及出血的內鏡微創治療，胃腸道早期癌的內鏡診斷及微創切除是我科的優勢。
我科與日本佐賀大學醫學部、美國哈佛大學、美國斯坦福大學、美國耶魯大學、美國路易斯安那州立大學、美國匹茲堡大學、香港中文大學等國際一流大學建立了良好的合作交流關系，這些合作正在促進我們消化內科向國際一流水準邁進。
